La Unidad Educativa Fiscomisional San Francisco de Asís, nace en 1979 como Centro Artesanal; en 1984, adquiere la categoría de Colegio Técnico Industrial; y, el 16 de noviembre de 1998, con el Acuerdo Ministerial 1456, nace lo que hoy es, la Unidad Educativa Fiscomisional “San Francisco de Asís”.
Los fundadores de esta institución educativa fueron: Fray Gerardo Vera, Mons. Manuel Valarezo y Fray Manuel Guerrero. Al año 2021 la Orden Franciscana lleva 473 años de presencia en la ciudad, casi cinco siglos de servicio pastoral, incluyendo 36 años de servicio en la pastoral educativa. Por su carácter de fiscomisional, la IE pertenece a la Confederación Ecuatoriana de Establecimientos de Educación Católica (CONFEDEC) y, por consiguiente, a la Federación de Establecimientos de Educación Católica (FEDEC) de Loja.